Misioni i Prefektit të Qarkut Berat është përmbushja e detyrimeve për të garantuar zbatimin e programit politik të Këshillit të Ministrave, në nivel qarku.
- Kujdeset,ndjek dhe merr masa për plotësimin nga të gjitha institucionet në nivel qarku të detyrimeve që ata kanë për të garantuar sovranitetin, rendin kushtetues dhe shëndetin publik;
- Mbikëqyr, kontrollon dhe bashkërendon veprimtarinë e institucioneve qendrore në nivel vendor;
- Drejton veprimtarinë e strukturave administrative shtetërore, të cilat me akte ligjore e nënligjore të veçanta, janë caktuar në varësinë e tij të drejtpërdrejtë;
- Bashkërendon veprimtarinë e institucioneve qendrore në nivel vendor, si dhe të këtyre me organet e qeverisjes vendore në qark;
- Është i vetmi institucion administrativ që verifikon ligjshmërinë e akteve te miratuara nga organet e qeverisjes vendore në bashki e qark. Në përputhje me dispozitat e kreut III të këtij ligji, Prefekti ushtron kontroll financiar mbi këto organe në mënyrën dhe limitet e përcaktuara me ligj.